Стейсі Ворнер (Села Ворд), що з'явилася в попередньому сезоні серіалу, продовжує впливати на життя Грегорі Гауса (Г'ю Лорі). Стейсі приводить до Гауса свого чоловіка, якого не можуть вилікувати інші лікарі, і Грегорі допомагає йому. Між героями виникає любовний трикутник - Грегорі визнає, що все ще кохає Стейсі, проте він не готовий до відновлення стосунків. Підспудно автори серіалу "Доктор Хаус 2 Сезон" натякають на можливий роман Грегорі та Лізи Кадді (Ліза Едельштейн).
Робота в лікарні забирає у Грегорі майже весь вільний час. При цьому він раз по раз відмовляється від виконання своїх обов'язків, аргументуючи свої вчинки пересічністю і буденністю більшості випадків. Його манера поведінки і цинічність призводять до того, що більша частина пацієнтів не довіряють ні Грегорі, ні запропонованим ним методам лікування.
Так само в цьому сезоні "Доктора Хауса" з'являються батьки Грегорі - це дає глядачам можливість дізнатися більше про його біографію. Гаус виріс у сім'ї військових, і владний характер батька наклав відбиток на самого діагноста. Вибір же професії лікаря відбувся завдяки знайомству з членом касти недоторканних у Японії, який володів видатними медичними знаннями, незважаючи на те, що був усього лише санітаром.
Протягом другого сезону серіалу "Доктор Гаус" Грегорі Гаус постійно стикається з етично складними ситуаціями, які вимагають від нього ухвалення непростих рішень: лікувати засудженого до смертної кари пацієнта, займатися велосипедистом, який приймає допінг, захищати колегу, який поставив невірний діагноз, аналізувати стан 15-річної топ-моделі - і багато іншого.
