Дана Скаллі (Джилліан Андерсон) призначена на роботу в Академію ФБР. А Моніка Рейс (Аннабет Гіш) стає новим напарником Джона Доггетта (Роберт Патрік) замість Скаллі. Доггетт виявляє в офісі "секретних матеріалів" понівечений труп. Думаючи, що він знайшов Малдера (Девід Духовни), Джон вирішує зробити експертизу ДНК, оскільки інакше впізнати тіло неможливо. понівеченої людини в офісі "секретних матеріалів", він думає, що це Малдер (Девід Духовни) і перевіряє його ДНК.
Пізніше виявляється, що тіло належить такому собі Джеффрі Спендеру (Кріс Оуенс) - зведений брат Малдера. Тим часом сам Малдер, щоб роздобути засекречену інформацію, наважується вийти з укриття. На військовій базі, щоб не розкрити себе, йому доводиться вбити людину. Пізніше з'ясовується, що людина, яку вбив Малдер - насправді суперсолдат, якого не можна вбити. Малдера попри це засуджують до смертної кари. Далі Скіннер (Мітч Пілледжі) і Доггетт допомагають йому і Скаллі втекти з країни.